Esta película comienza con un hombre que cae desde lo alto de una ciudad llamada Free City. El narrador nos explica que los tipos como él, que llevan lentes, son los héroes y pueden hacer lo que sea, como tomar autos y ser acompañados por quien ellos quieran, además de poder hacer lo que quieran. Sus opciones son ilimitadas. Por otro lado, conocemos a Guy, un chico común y corriente que siempre usa la misma ropa y trabaja en un banco. Sale a las calles y parece que pasan cosas raras, pero el chico continúa como si nada. Luego llega a su trabajo en el banco, donde parece que llegan ladrones, pero él solo charla con su amigo el guardia como si todo esto fuera normal.
Cerca de ahí, vemos a dos personas que se reúnen, donde una chica llamada Millie tiene la ubicación de algo que busca. Así que va hacia allá y se topa con muchas personas y parece que sabe lo que van a decir, mientras Guy la observa desde lejos y se queda impresionado. Así que decide seguirla. Mientras su amigo le dice que no debería, ya que estas trajes de sol y no deberían hablar con ellos, aún así, Guy va tras ella. Por lo que trata de alcanzarla, pero al estar a punto de llegar, parece que pasa el tren y lo manda al más allá. Mientras tanto, nos damos cuenta de que Free City en realidad es un videojuego y era una jugadora.
Mientras tanto, en Free City, vemos que un NPC es reiniciado en su casa, donde vuelve a tener su día igual. Así que va por su café, pero esta vez decide pedir uno diferente. Por lo que a todos los que estaban allí les empieza a extrañar, e incluso alguien con un gran auto fuera le quiere apuntar. Por lo que mejor decide tomar lo mismo de siempre y todo sigue normal. Después, en su trabajo, llega un ladrón. En ese momento, ve a Millie, por lo que su amigo le repite que ya tiene su traje de sol y no debe acercarse a ella. No obstante, que hay algo diferente y le pide los lentes al ladrón. Pero como no se los quiere prestar, tiene que tomarlos. Al ponérselos, ve un mundo totalmente diferente, ya que ve lo que ven los jugadores en línea. Entonces, Guy empieza a interactuar con su nueva perspectiva como jugador. Y si hace algunos billetitos en el mundo real, vemos que dos programadores se dan cuenta del comportamiento de Guy. Por lo que creen que es un jugador que usa la skin del chico. Debido a ello, rápidamente crean un supersonaje y están por entrar al juego.
Mientras tanto, Guy se compra los tenis que siempre quiso. Luego, los programadores, llamados en sus skins, entran al juego y tratan de detener a Guy, el cual trata de escapar. Mientras se da cuenta de que sus tenis en realidad tienen habilidades. Por lo que los usa para lograr escapar de ellos. Pero lo malo es que, al ser programadores, rápidamente tienen la ventaja dentro del juego. Así que se vuelven a acercar a él. Debido a ello, Guy se lanza desde lo alto y, con las habilidades de los lentes, logra salvarse. Por lo que se levanta y se cree invencible. No obstante, los trabajadores terminan su trabajo rápidamente en el mundo real. Aquí, Guy está confundido, ya que nunca supieron quién era el jugador que estaba detrás de todo.
Después, vemos en un no muy lejano lugar, donde Kiss y Millie eran compañeros. Juntos desarrollaron un motor de inteligencia artificial. Parece que tenían grandes planes. En ese momento, llega Antoine a su casa y se da cuenta de que Millie estaba ahí. Pero parece que el jefe de Kiss se robó el motor de la guía. Aunque parece que el chico no cree esto y está despreocupado por ello.
Por otro lado, vemos que Guy despierta y cada vez está más consciente de lo que pasa. Mientras tanto, Millie se conecta a la ubicación que descubrió, donde podrá encontrar las pruebas de que les quitaron el motor de la guía. Pero en el lugar se encuentra con Guy. Aunque, como él está en los lentes, cree que es un jugador. Entonces, la situación se complica en el lugar. Por lo que Antoine y Guy luchan, y ella sigue a Millie, por lo que van a su guarida. Donde Guy cree que es nuevo en el juego. Así que le explica que, si quiere acompañarle en su misión, tiene que subir de nivel para usar algunas habilidades. Así que le pide que llegue al nivel 100, y después podrán seguir juntos.
Debido a ello, Guy va por la ciudad y empieza a derribar a los jugadores para ganar puntos y salvar a los NPCs. Por lo que rápidamente se vuelve viral en el mundo real. Más tarde, llega Antoine de la compañía de videojuegos, llamado Antoine, quien comenta que dejan libre a Guy, ya que está siendo más popular el videojuego. Por lo que todo esto se convierte en ganancias para él. Pasa el tiempo, y vemos que Guy consigue un alto nivel. Por lo que rápidamente va con Millie y le muestra su guarida, la cual nota que ha avanzado mucho. Entonces, Millie le pregunta quién es en realidad en el mundo real, pero Guy sigue diciendo que él es el mismo. Así que ella cree que es un modelo que no quiere revelar su identidad.
Luego, se conocen mejor y terminan dándose un beso. Mientras en el mundo real, Millie no puede creerlo. Luego se despide de él y se desconecta. Ya que llega Antoine a su casa, y le dice que descubrirá la verdad. Así que les hace saber que actúa si usó su motor de inteligencia artificial y que el Guy que todos conocen en internet es la primera inteligencia artificial avanzada que se ha creado.
Mientras que Millie no puede creer que se haya besado con él. Pero lo peor es que se dan cuenta de que Antoine está por lanzar un parche que borraría todo el código del primer juego. Así que deben rescatar su motor de guía y también a Guy. Por lo que deciden que deben saber la verdad. Y para que les ayude a salvar la ciudad. Por lo que Millie se conecta de nuevo. Le explica lo que pasa, pero Guy no lo toma nada bien. Ya que se siente vacío. Se aleja de ella. Y, por su cuenta, descubre que tenía razón. Así que trata de convencer a más NPCs de que no son reales. Pero parece que nadie entiende.
Luego, Guy habla con su amigo llamado Woody, quien lo tranquiliza y le hace ver que todos son especiales. Y si aprecia a alguien, debe ayudarlo. Por lo que juntos deciden ir a la guarida de antes, donde un jugador tiene la evidencia que buscan. Millie llega al jugador, y no se le ve buena pinta. Pero, por suerte, es fan de Guy. Así que le entrega lo que buscan, y se le ve muy emocionado de conocerlo. Después, va con Millie y le entrega la evidencia. Mientras en el mundo real, Antoine no lo pasa muy bien. Ya que tiene muchos fallos y ya no tiene a X para que se lo resuelva. Luego, Antoine trata de invitar a Millie a tomar un café. Pero ella prefiere estar en el juego. Así que se conecta de nuevo. Y nota que el mundo es muy diferente y lleno de alegría. Guy se da cuenta de que, en realidad, él es solo un mensajero. Ya que X personalmente lo programó con sus sentimientos. Así que sale corriendo.
Por otro lado, Guy está con su clon grandulón. Pero extraña mucho a su amigo Buddy, el cual pronto es reprogramado. Así que juntos disfrutan de su nuevo mundo.